تمثل الدراسات العليا ببرامجها المختلفة ودرجاتها العلمية أحد عناوين الرقي والتقدم في الجامعات ومؤسسات التعليم العالي، كما تمثل الدراسات العليا ركيزة قوية لكونها تُمد المجتمعات، بالكفاءات والطاقات العلمية المؤهلة في المجالات العلمية المختلفة القادرة على وضع حلول لمشكلات المجتمع والتخطيط للنهوض به، وهذا يضع على كاهل القائمين على الدراسات العليا في جامعة المؤسس مسؤولية المزاوجة بين الأصالة والمعاصرة في برامج الدراسات العليا، وضع أسس لصياغة هذه البرامج بما يكفل تمكين الطلاب من ملاحقة التقدم المذهل في العلوم والتقنيات، ومواجهة الزيادة الكبيرة في الطلب على الالتحاق ببرامج الدراسات العليا بالتوسع في البرامج والدرجات العلمية دون تفريط في مستويات كفاءة وجودة العمليات التعليمية والبحثية.

وقد أولت رؤية المملكة 2030 عناية خاصة بالتعليم وتأهيل الكوادر وبخاصة في الدراسات العليا حيث ركزت الرؤية على أهمية مساهمة التعليم في دفع عجلة الاقتصاد وسد الفجوة بين مخرجات التعلم ومتطلبات سوق العمل، وإتاحة الفرصة لإعادة تأهيل الطلاب والمرونة في التنقل بين مختلف المسارات التعليمية، وتمكين خمس جامعات سعودية لأن تصبح من أفضل (200) جامعة دولية بحلول عام (1452هـ -2030م) وهذا بدورة يلقي بمسئولية كبيرة على الجامعات نحو تطوير برامجها التعليمية وتحقيق موائمتها لسوق العمل وجودة مخرجاتها.

بدأت برامج الدراسات العليا بجامعة الملك عبد العزيز في عام 1390هـ ب كلية علوم الأرض والذي كان وقتها معهد الجيولوجيا التطبيقية، ومن ذلك الوقت بدأ التوسع في التخصصات العلمية إلى أن وصل في الفصل الدراسي الأول 1443هـ إلى مائتين وثمانية وأربعين (248) برنامجا. كما أن عدد طلاب الدراسات العليا المقيدين بجامعة الملك عبد العزيز حسب الدرجة للفصل الدراسي الأول 1443هـ وصل إلى ما يقارب التسعة آلاف طالب وطالبة موزعين على كليات الجامعة حسب التخصصات الرئيسية الأربع التالية:

1.  كليات العلوم الأساسية والحياتية:

وتشمل كلية العلوم – كلية العلوم والآداب برابغ – كلية علوم الارض – كلية علوم البحار – كلية الارصاد والبيئة وزراعة المناطق الجافة

2.  كليات العلوم الهندسية وتقنية الحاسبات:

 وتشمل كلية الهندسة – كلية العمارة والتخطيط - كلية الحاسبات وتقنية المعلومات- كلية الدراسات البحرية – كلية الهندسة برابغ.

3.  كليات العلوم الصحية: 

وتشمل كلية الطب – كلية طب الاسنان – كلية الصيدلة – كلية العلوم الطبية التطبيقية- كلية التمريض – كلية علوم التاهيل الطبي

4.  كليات العلوم الاجتماعية والانسانية:

وتشمل كلية الآداب والعلوم الانسانية – كلية الاقتصاد والادارة – معهد الاقتصاد الاسلامي - كلية الحقوق- كلية الدراسات العليا التربوية - كلية علوم الإنسان والتصاميم- كلية السياحة - كلية الاتصال والاعلام- كلية الدراسات التطبيقية -  معهد اللغة العربية للناطقين بغيرها – معهد اللغة الانجليزية – معهد الأمير خالد الفيصل للاعتدال .